《高新技術(shù)認(rèn)定管理辦法》第四條規(guī)定：依據(jù)本辦法認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)，可依照《企業(yè)所得稅法》及其《實(shí)施條例》、《中華人民共和國稅收征收管理法》（以下稱《稅收征管法》）及《中華人民共和國稅收征收管理法實(shí)施細(xì)則》（以下稱《實(shí)施細(xì)則》）等有關(guān)規(guī)定，申請享受稅收優(yōu)惠政策。

《高新技術(shù)企業(yè)管理工作指引》中明確規(guī)定“各相關(guān)單位應(yīng)依據(jù)《認(rèn)定辦法》、《重點(diǎn)領(lǐng)域》，結(jié)合本《工作指引》，開展高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作。”同時還規(guī)定，“只有依照《認(rèn)定辦法》、《重點(diǎn)領(lǐng)域》，結(jié)合本《工作指引》所認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)即為《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第28條所稱國家需要重要扶持的高新技術(shù)企業(yè)。

從上述規(guī)定可以看出，全國的高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定的依據(jù)只能是由科技部、財政部、國家稅務(wù)總局聯(lián)合制訂的《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》、《高新技術(shù)企業(yè)管理工作指引》和《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作指引》。各省市于2008年1月1日之前頒布實(shí)施的認(rèn)定依據(jù)和標(biāo)準(zhǔn)不再適用。

由于《認(rèn)定辦法》是經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)實(shí)施的，其效力等級屬于行政法規(guī)，仍次于國家法律，因此，各省市必須按此規(guī)定組織各自的認(rèn)定組織工作。

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