1974年10月25日，國務(wù)院環(huán)境保護領(lǐng)導(dǎo)小組正式成立，標志著我國歷史上第一個環(huán)境保護機構(gòu)的誕生。

1982年3月，國務(wù)院環(huán)境保護領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室與國家建委、國家城建總局、建工總局、國家測繪總局合并組建城鄉(xiāng)建設(shè)環(huán)境保護部，內(nèi)設(shè)環(huán)境保護局。

1984年5月，國務(wù)院作出了《關(guān)于加強環(huán)境保護工作的決定》，為加強部門協(xié)調(diào)，決定成立國務(wù)院環(huán)境保護委員會。

1984年12月，城鄉(xiāng)建設(shè)環(huán)境保護部下屬的環(huán)境保護局改為國家環(huán)境保護局，作為國務(wù)院環(huán)境保護委員會的辦事機構(gòu)，負責全國環(huán)保的規(guī)劃、協(xié)調(diào)、監(jiān)督和指導(dǎo)工作。

1988年，國務(wù)院決定獨立設(shè)置國家環(huán)境保護局，作為國務(wù)院的直屬機構(gòu)，也是國務(wù)院環(huán)境保護委員會的辦事機構(gòu)，負責統(tǒng)一監(jiān)督管理全國的環(huán)境保護工作。

1998年，國務(wù)院機構(gòu)改革力度加大，將環(huán)保部門升格，設(shè)置了正部級的國家環(huán)境保護總局。

2008年3月，十一屆全國人大一次會議在《國務(wù)院機構(gòu)改革方案》說明中明確，為加大環(huán)境保護政策、規(guī)劃和重大問題的統(tǒng)籌協(xié)調(diào)力度，決定組建環(huán)境保護部。同年3月27日，環(huán)境保護部揭牌儀式在北京舉行。

環(huán)境保護部內(nèi)設(shè)辦公廳、規(guī)劃財務(wù)司、政策法規(guī)司、行政體制與人事司、科技標準司、污染物排放總量控制司、環(huán)境影響評價司、環(huán)境監(jiān)測司、污染防治司、自然生態(tài)保護司、核安全管理司、環(huán)境監(jiān)察局、國際合作司、宣傳教育司14個機構(gòu)。

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